天才科学家恶之宫博士（柄本明 饰）在遭到国家的背叛之后，满怀着仇恨怒火组建了邪恶细胞军团Σ。他命令爪牙四处抓捕并吸取政要的细胞，以制造足以毁灭世界的恐怖武器。在此期间，于遗传领域有着卓绝贡献的大门勇博士（竹中直人 饰）拒绝与恶之宫合作而惨遭杀害。大门博士的儿子大门丰（古原靖久 饰）与父亲开发的电人查勃卡为了正义，与细胞军展开艰苦卓绝的斗争，期间还与本为敌人的博格小姐（山崎真实 饰）。但是，他所笃定坚持的正义最终将查勃卡引向灭亡。25年后，潦倒不堪的大门丰（板尾创路 饰）委身于无良政客若杉（木下ほうか 饰），受尽屈辱，而恶之宫的邪恶计划则接近完成……本片根据20世纪70年代同名特摄剧改编。
动作片